Doctorat (Phd) en Biologie Moléculaire - Quebec City, Canada - Centre de Recherche, Institut Universitaire de Cardiologie et Pneumologie, Université Laval

Description

**Doctorat (PhD) en biologie moléculaire, génétique et génomique fonctionnelle**:

- Réf **ABG-121373**
- Sujet de Thèse- 19/03/2024- Autre financement public- Centre de Recherche, Institut Universitaire de Cardiologie et Pneumologie, Université Laval- Lieu de travail- Québec - Canada- Intitulé du sujet- Doctorat (PhD) en biologie moléculaire, génétique et génomique fonctionnelle- Champs scientifiques- Biologie
- Santé, médecine humaine, vétérinaire
- Science de la donnée (stockage, sécurité, mesure, analyse)
- Mots clés- Expression/régulation génique, Génome 3D, chromatine, enhancers, maladies cardiovasculaires, randomisation mendélienne, GWAS.**Description du sujet**:
Les intérêts de recherche du laboratoire s'articulent autour de la compréhension des mécanismes génétiques et moléculaires impliqués dans le développement et la progression des maladies cardiovasculaires, notamment la sténose aortique et la maladie coronarienne. Longtemps perçue comme une succession d'évènements passifs liés au vieillissement, ces pathologies découlent d'un processus cellulaire complexe menant à l'altération de mécanismes moléculaires et/ou épigénétiques dérégulant ainsi le programme transcriptionnel. Dans ce contexte, plusieurs stratégies expérimentales et analytiques font l'objet d'une attention particulière au sein du laboratoire.

**Identification d'acteurs moléculaires impliqués dans la physiopathologie des maladies cardiovasculaires. **En travaillant sur les** **ARN non codants long et les régions régulatrices du génome (promoteurs, enhancers) nous cherchons à déterminer comment ces régulateurs participent à l'établissement d'un phénotype pathologique, et les conséquences de la dérégulation de leurs gènes cibles sur la fonction biologique. Pour répondre à ces objectifs, nous utilisons des modèles de culture cellulaire (lignées et primaires) combinés à des approches de génomiques (CRISPR/Cas9, RNA-seq, csRNA-seq, ChIP-seq, HIChIP, single-cell RNA-seq, ATAC-seq) ainsi que l'analyses des données qui en découlent.

**Approche multimodale visant à comprendre la génétique des maladies cardiovasculaires**. L'intégration des QTL d'expression et de protéines aux données d'études d'association pangénomique (GWAS) permet l'inférence causale par randomisation mendélienne (RM). En utilisant la RM, nous nous intéressons à la manière dont l'inférence causale peut aider à identifier les principaux gènes causaux de la maladie dans les voies prioritaires du réseau. Parallèlement nous intégrons des données multidimensionnelles (RNA-seq, ChIP-seq, HiChIP, scRNA-seq, etc.) qui permettent d'identifier les réseaux d'expression de gènes impliqués dans le développement de cette maladie. Nous mettons également en lumière de nouveaux marqueurs de la pathologie, ainsi que de nouvelles voies de régulation en mettant en œuvre des algorithmes informatiques permettant en bout de ligne de mieux définir les molécules à visée thérapeutique.

**Prise de fonction**:

- 01/09/2024**Nature du financement**:

- Autre financement public**Précisions sur le financement**:

- Canadian Institutes of Health Research - CIHR**Présentation établissement et labo d'accueil**:

- Centre de Recherche, Institut Universitaire de Cardiologie et Pneumologie, Université LavalLe laboratoire du Dr Patrick Mathieu est à la recherche d'étudiants dynamiques et motivés pour se joindre à son équipe afin de réaliser une thèse de doctorat axé sur la compréhension des mécanismes génétiques et moléculaires impliqués dans le développement des maladies cardiovasculaires. Le laboratoire du Dr Mathieu est affilié à l'Université Laval et est situé à l'Institut de Cardiologie et de Pneumologie de Québec (IUCPQ), centre qui regroupe des axes de recherche en cardiologie, en pneumologie et en obésité/métabolisme, trois sphères à fort impact économique et sociétal considérant les maladies qui y sont liées. De par son expertise en traitement des maladies cardiovasculaires, l'IUCPQ procure à notre équipe de recherche une ressource unique et précieuse de cellules primaires, mises en culture à partir de tissus cardiaques provenant de patients opérés.

**Site web**:
**Intitulé du doctorat**:

- Programme de PhD en Médecine Moléculaire de l'Université Laval**Pays d'obtention du doctorat**:

- Canada**Etablissement délivrant le doctorat**:

- Université Laval**Qualifications**:
Avoir obtenu un diplôme de **master** dans l'un des domaines suivants ou équivalent : Sciences biomédicales, Biologie, Biochimie, Microbiologie, Bio-informatique.
- De fortes connaissances théoriques en biologie cellulaire et moléculaire;
- De solides compétences en travail de laboratoire (EX: qRT-PCR, western blot, culture cellulaire, ChIP, etc.)
- Un esprit analytique et qui aime résoudre des problèmes complexes;
- De très bonnes